CRISPR质粒构建
CRISPR / Cas9技术成功进行基因编辑的关键步骤包括sgRNA的设计和构建,sgRNA决定了打靶的特异性。百奥赛图专业的技术团队精心设计和检测sgRNA,确保高特异性和高活性的进入下一步实验。
服务说明
sgRNA靶向物种 | sgRNA启动子 | 质粒筛选标记b | 交付内容 | 交付条件c | 可选服务d | 交货时间 |
大鼠,小鼠,人类,灵长类动物和其他哺乳动物a | U6 T7 | PuroR PuroR | 质粒 测序结果 质量报告 | 总量> 5μg 浓度> 50 ng /μL 酶切验证 Sanger测序 | sgRNA效率测定 | 10个工作日 |
大小鼠外其他物种的基因靶向sgRNA设计请联系我们。
如需其他抗性基因和荧光报告基因标记可按照要求提供,请咨询我们。
可根据要求提供不同数量的质粒。可提供无内毒素的maxiprep质粒。
我们提供如上所述体外sgRNA分析服务。
服务程序
1.确认sgRNA靶向基因
2.设计sgRNA并与客户确认
3.构建和检测质粒
4.运输质粒和质量报告
CRISPR活性测定
设计sgRNA后,非常关键的一步是快速准确地选择高活性sgRNA 百奥赛图开发了UCA检测方法[1],能够在体外高灵敏、便捷、快速测定sgRNA活性。UCA检测方法兼具高通量特点。 UCA检测方法基于单链退火(SSA)机制[1](图1)。
图1.使用SSA机制确定CRISPR / Cas9活性的示意图。
将CRISPR / Cas9真核表达质粒(表达Cas9和sgRNA)和pUCA质粒共转染到细胞中后,Cas9-sgRNA复合物将结合并切割对应于pUCA质粒上sgRNA的靶位点。触发SSA的DNA修复机制,当萤光素酶(er)的同源互补序列形成萤光素酶的完整编码序列时,该基因将被表达。萤光素酶活性表示sgRNA活性值;荧光素酶信号越高,表明sgRNA活性越高。
现在,许多sgRNA设计工具都具有预测sgRNA活性的功能。但预测结果和实际活性之间仍然存在很大差异。必须通过实验验证sgRNA活性,以确保后续实验的成功率。
我们的数据表明,UCA检测方法能够很好地预测sgRNA的体内活性,该方法已在高影响力期刊中引用[2,3]。通过百奥赛图UCA系统检验的高活性sgRNA有助于CRISPR / Cas9基因编辑的成功。
服务优势
1.高效,快速:从sgRNA设计到通过活性测定总计2周时间
2.灵敏,准确且接近体内活性
3.没有物种限制
[1]. Mashiko, D, et al. “Feasibility for large-scale mouse mutagenesis by injecting CRISPR/Cas plasmid into zygotes. ” Development Growth & Differentiation 56.1(2014):122.
[2]. Wu M, Wei C, Lian Z, et al. Rosa26-targeted sheep gene knock-in via CRISPR-Cas9 system[J]. Scientific reports, 2016, 6.
[3]. Lin, Zhimiao, et al. “Stabilizing mutations of KLHL24 ubiquitin ligase cause loss of keratin 14 and human skin fragility.” Nature Genetics 48.12 (2016): 1508-1516.
供体质粒构建
百奥赛图拥有10多年基因编辑课题经验,开发了数千个小鼠,大鼠和细胞系项目。可以构建用于基于ESC/EGE基因编辑的打靶载体和用于Tol2转基因的载体,提供快速的质粒设计和构建服务。
服务说明
种属 | 可交付成果 | 交货条件 | 可选服务 |
大鼠 小鼠 细胞系 | 质粒 测序结果 质量报告 | 总量> 5μg 浓度> 50 ng /μL 酶切验证 Sanger测序 | 无内毒素的maxiprep质粒 原核注射及质粒抽提 |
服务流程
1. 确认目的基因,设计基因编辑策略;
2. 设计质粒序列,并与客户确认;
3.构建和检测质粒;
4.运输质粒和质量报告